Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms