Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms