Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snw1Q9CSN1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snw1Q9CSN1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms