Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msmo1Q9CRA4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msmo1Q9CRA4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msmo1Q9CRA4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msmo1Q9CRA4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms