Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NmbQ9CR53 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NmbQ9CR53 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms