Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms