Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931417E11RikQ9CR05 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms