Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms