Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PclafQ9CQX4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms