Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nicn1Q9CQM0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nicn1Q9CQM0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nicn1Q9CQM0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nicn1Q9CQM0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nicn1Q9CQM0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nicn1Q9CQM0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nicn1Q9CQM0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nicn1Q9CQM0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nicn1Q9CQM0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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