Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccer1Q9CQL2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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