Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd2aQ9CQJ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Higd2aQ9CQJ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms