Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snrpb2Q9CQI7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms