Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmed6Q9CQG0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed6Q9CQG0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed6Q9CQG0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmed6Q9CQG0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms