Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQF4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQF4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms