Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NenfQ9CQ45 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NenfQ9CQ45 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NenfQ9CQ45 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NenfQ9CQ45 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms