Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Commd4Q9CQ02 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms