Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg3Q9CPX6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg3Q9CPX6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms