Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf2a1Q99PM3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms