Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg5Q99PE8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcg5Q99PE8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms