Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup155Q99P88 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup155Q99P88 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup155Q99P88 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms