Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Bco2Q99NF1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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