Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a8Q99N10 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a8Q99N10 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms