Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkd1Q99MH6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms