Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnaja3Q99M87 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaja3Q99M87 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.8 ms