Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp16Q99LG0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms