Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RtcbQ99LF4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtcbQ99LF4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtcbQ99LF4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms