Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clint1Q99KN9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms