Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms