Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2aQ99KJ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms