Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krcc1Q99JT5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms