Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec3Q99J72 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms