Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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