Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SptssbQ925E8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SptssbQ925E8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms