Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prss28Q924N9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms