Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms