Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b3Q921M3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms