Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Afg3l1Q920A7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms