Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l3Q91XE9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Creb3l3Q91XE9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms