Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klc3Q91W40 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klc3Q91W40 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc3Q91W40 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc3Q91W40 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc3Q91W40 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc3Q91W40 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc3Q91W40 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc3Q91W40 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klc3Q91W40 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms