Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce2Q91VT1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce2Q91VT1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms