Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn8Q91VA3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn8Q91VA3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn8Q91VA3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn8Q91VA3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn8Q91VA3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn8Q91VA3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn8Q91VA3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn8Q91VA3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms