Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng5Q8VHW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms