Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms