Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 524.7 ms