Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cul7Q8VE73 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul7Q8VE73 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul7Q8VE73 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms