Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdlbpQ8VDJ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HdlbpQ8VDJ3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HdlbpQ8VDJ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HdlbpQ8VDJ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HdlbpQ8VDJ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HdlbpQ8VDJ3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms