Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fyco1Q8VDC1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms