Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8VCE4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VCE4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms