Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Exosc2Q8VBV3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc2Q8VBV3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms